高企税务稽查风险企检·第5问：亏损企业能申请高企吗？

“我们公司连续两年亏损，还能申请高企吗？亏损会不会被一票否决？”

这是我在过去一年里，听到处于成长期的企业老板问得最焦虑的一个问题。

每次被问到，我都会反问一句：“你知道高企认定的核心指标是什么吗？亏损在不在其中？”

对方往往能答出“研发费用占比、科技人员占比、高新收入占比”，但不清楚亏损到底会不会影响认定。

亏损企业可以申请高企。亏损不直接影响认定，但亏损状态下，你的研发费用占比更容易被质疑。

一、先回答表层问题：亏损不影响认定，但数据真实性审查更严

根据《高新技术企业认定管理办法》（国科发火〔2016〕32号），高企认定的核心指标包括：科技人员占比、研发费用占比、高新收入占比、知识产权、科技成果转化能力、研究开发组织管理水平、企业成长性。“是否亏损”不是认定条件之一。

亏损企业可以申请高企，也可以享受15%的优惠税率——前提是你通过了认定。

但亏损企业有一个天然的“劣势”：你的研发费用占比更容易“达标”，但也更容易被质疑。

研发费用占比的计算公式是：研发费用 ÷ 销售收入。如果你的销售收入很低（因为亏损、营收下滑），即使研发费用绝对值不高，占比也可能轻松超过3%或4%或5%的标准线。在税务局眼里，你的数据“达标得太容易了”，他们会更加怀疑数据的真实性。

二、问题的底层逻辑是：亏损状态下，你的研发费用占比经得起“合理性”质疑吗？

底层逻辑一：亏损本身不违规，但亏损状态下研发费用占比“虚高”容易被系统标记。

一家营收1亿、研发费用300万的企业，研发费用占比3%，刚好达标。一家营收2000万、研发费用100万的企业，研发费用占比5%，也达标。

但税务局在案头分析时，会问一个问题：一家营收2000万的企业，花100万搞研发——这个投入合理吗？这笔钱花在哪里了？有没有对应的研发项目？有没有对应的成果？

如果你的研发费用占比“虚高”，但研发成果却不明显——没有专利、没有新产品、没有技术突破——税务局就会判定你的研发费用“真实性存疑”。

底层逻辑二：亏损企业更急于“拿补贴”，更容易在材料上“凑数”。

这是税务局的一个“默认假设”：亏损企业现金流紧张，有更强的动机通过高企认定来享受税收优惠、获得政府奖励。在这种动机下，企业更可能在材料上“凑数”——科技人员名单里塞进无关人员、研发费用里塞进无关费用、专利临时购买充数。

2026年的审核中，税务局的案头分析会重点关注亏损企业的“异常达标”情况。如果你的数据“刚好达标”且企业处于亏损状态——系统会自动提高风险评分，进入重点核查名单。

底层逻辑三：亏损企业的成长性评分本来就低，更容易在总分上“翻车”。

高企认定满分100分，其中成长性指标占20分。成长性指标包括净资产增长率和销售收入增长率。亏损企业的这两个指标往往是负数——成长性得分可能只有几分甚至0分。

成长性丢分意味着你需要从其他模块（知识产权、科技成果转化、研发组织管理）拿更多分来弥补。而亏损企业往往在研发投入、人员配置、管理体系上本身就比较薄弱——丢分越多、越难通过。

三、真实案例：亏损企业被重点审查的典型案例

案例一：某5人公司申请被退回

某企业2025年仅有职工5人，工资均未超过5000元/月，处于亏损状态，不具备配置科技人员的条件。税务局案头分析中直接判定：该企业不具备从事研发活动的基本人员配置，不同意推荐。

5个人、月薪不到5000、亏损——三项特征叠加，在系统里就是红色预警。

案例二：某唱片及唱片机制造企业——连续三年精准5%

该企业2024年申报的研发费用占销售收入比重连续三年均为5%，精准“卡线”。企业处于微利状态，数据“达标得太漂亮了”。税务局判定其创新性存疑，进入重点核查名单。

案例三：某企业研发费用辅助账分摊比例可疑被退回

某亏损企业研发费用辅助账中，人员费用、直接投入等明细项目按固定比例平均分摊，无实际发生依据。税务局判定支出真实性存疑，要求补充佐证材料。

四、如果被查到了，后果是什么？

亏损企业被查到问题后，后果一样严重：

资格被取消，补缴三年税款及滞纳金

虽然你亏损时没有税款可补，但如果你在亏损之后开始盈利了——追缴的税款可能相当可观。朗姿股份补缴5256万元。

更严重的是：亏损企业的“虚列研发费用”可能同时涉及偷税风险。

如果你在亏损状态下虚列了研发费用，同时通过这个虚列的研发费用享受了加计扣除——这就不是“补税”的问题了，而是“骗取税收优惠”的问题。

某医药企业实控人通过虚假委托研发合同帮助药企维持高企资格，造成少缴税款233.99万元，被移送公安机关。

纳税信用等级下调，融资更困难

亏损企业本身融资就困难，纳税信用再降级——银行贷款基本就停了，政府项目也投不了标。

五、你现在可以做的三件事

第一件事：确保你的研发费用是“真”的，不是“做”出来的。

亏损企业最大的风险在于：你的研发费用占比“达标”太容易了，税务局会质疑它的真实性。

逐笔核对你的研发费用：每一笔费用都有真实的发票、合同、付款记录吗？每一笔费用都对应了具体的研发项目吗？每一个研发项目都有立项书、工时记录、成果报告吗？如果有任何一笔费用经不起追问，现在主动剔除，比被税务局查出来要好得多。

第二件事：确保你的科技人员是“真”的，不是“凑”出来的。

亏损企业往往人员规模小，更容易在科技人员上“凑数”。逐人核对：每个人的社保都在本公司缴纳吗？每个人的累计工作时间超过183天吗？每个人在现场核查时能说清楚自己参与了哪个研发项目吗？

第三件事：如果你的亏损是暂时的，准备好“解释你的亏损”。

税务局会问：你为什么亏损？是因为行业周期、研发投入过大、还是经营不善？如果你的亏损是因为“投入了大量研发”——那正好，你的研发费用应该是真实发生的，有完整的证据链可以证明。

六、如果你不确定自己的状态

亏损企业申请高企不是不可能，但难度更大、审查更严。你的每一笔费用、每一个人员、每一项数据都会被更严格地审视。

如果你不确定自己的亏损状态是否会影响高企认定，或者不确定自己的研发费用真实性是否经得起审查——现在联系我们，我们口头告诉你结论。

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专知智库·合规风险观测组

亏损企业申请高企常见问题FAQ

问：亏损企业能申请高企吗？

答：可以。亏损不是高企认定的否决项。但亏损状态下，研发费用占比更容易“虚高”，税务局的审查会更严。

问：亏损企业申请高企会被重点审查吗？

答：会。税务局案头分析中会重点关注亏损企业的“异常达标”情况。如果数据“刚好达标”且企业处于亏损状态，系统会自动提高风险评分。

问：亏损企业的成长性评分会不会很低？

答：会。成长性指标占20分，亏损企业的净资产增长率和销售收入增长率往往是负数，成长性得分可能只有几分甚至0分。需要从其他模块（知识产权、科技成果转化）多拿分来弥补。

问：亏损状态下虚列研发费用有什么额外风险？

答：亏损企业虚列研发费用，同时通过虚列的费用享受加计扣除——可能被认定为“骗取税收优惠”，不仅涉及补税，还可能涉及刑事责任。

问：亏损企业申请高企应该注意什么？

答：确保研发费用真实、科技人员真实、证据链完整。亏损状态下，审查人员对数据真实性的要求更高，容错空间更小。